Pentru a aprecia evoluţia cazurilor de tuberculoză aflate în tratament, se efectuează periodic controlul bacteriologic al sputei. Acesta se aplică în cazurile care erau iniţial confirmate bacteriologic-microscopic sau prin cultură, fie că erau cazuri noi pulmonare sau extrapulmonare extinse, tratate conform categoriei I de tratament, fie că erau recidive, tratamente după abandon, eşecuri tratate conform categoriei II, fie că erau cazuri noi pulmonare cu bK negativ microscopic sau extrapulmonare limitate, tratate cu ajutorul categoriei III. Aceste informaţii au fost prezentate mai pe larg la capitolul „tratamentul tuberculozei”.

Tabelul de mai jos sintetizează frecvenţa / momentele controlului bacteriologic.

Tipuri de pacienţi (categorii de tratament)	Momentul examinării
Categoria I (caz nou bk+m)	la depistare T0	la sfârşitul lunii 2 T2	în luna a 5‑a T5	la sfârşitul lunii a 6‑a T6
Categoria II (recidiva, abandon, eşec, altele)	la depistare T0	la sfârşitul lunii 3 T3	în luna a 5‑a T5	la sfârşitul lunii a 8‑a T8
Categoria III (caz nou bk+m, tbc extrapulmonar)	la depistare T0	la sfârşitul lunii 2 T2

Este posibil ca pacienţii bolnavi de tuberculoză să prezinte un ritm de debacilizare mai lent; în aceste cazuri specialistul pneumoftiziolog va recomanda controale la intervale mai mici (şi în luna a 3‑a, a 4‑a, etc). Tot în mod individualizat sunt controlaţi şi pacienţii cu tuberculoza pulmonară cronică, cazurile cu poli – chimiorezistenţa. În funcţie de evoluţia clinică şi bacteriologică a cazurilor acestea vor fi controlate şi radiologic.